2004年SARS-CoV毒株S基因分子进化特征

• 作者: 俞守义 宋怀东 李晖 邹丽容 黄平
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 学科: 医学
• 关键词: 严重急性呼吸综合征 SARS-冠状病毒 S基因 进化
• 年，卷（期）: 2006,（10）
• 所属期刊栏目: 实验研究
• 页码范围: 957-960
• 页数: 4页
• 分类号: R3
• 字数: 2773字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2694.2006.10.016

摘要

目的 通过对2004年SARS-CoV毒株S基因序列的变异分析,揭示SARS-CoV毒株S基因进化与SARS流行的关系.方法 对广东地区2004年2株SARS-CoV毒株S基因进行序列分析,其余15株毒株S基因序列从GenBank检索,采用DNAStar5.0软件,对检索的SARS-CoV的S基因核苷酸序列进行比对和分析;并结合临床资料对变异毒株进行进化速度分析.结果 17株毒株中,S基因7个氨基酸位点全部置换,35个氨基酸位点在不同毒株中置换;所有SARS-CoV均通过氨基酸227位点的置换,增加一个糖基化位点.同义进化中,S基因置换速度为1.46×10-6个核苷酸,进化线性回归方程为Y＝1.46×10-6X+0.000736,同时通过Ka计算显示S基因进化明显存在选择性压力.2004年17株SARS-CoV毒株可以分为两条进化途径,其中广东地区的人类的GZ0401毒株与果子狸的PC4-115毒株核苷酸同源性达到99.97%,氨基酸同源性为100%.结论 冠状病毒S基因的1个糖蛋白位点增加,可能导致人类SARS-CoV毒株出现并SARS流行;2004年果子狸冠状病毒与人类SARS-CoV毒株分子结构类似,可能存在交叉宿主.S基因同义进化速度较流感HA1基因慢4.2倍,但基因进化明显存在选择性压力.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	俞守义	南方医科大学流行病学教研室	142	1125	17.0	26.0
2	黄平		60	448	11.0	16.0
3	宋怀东	上海第二医科大学附属瑞金医院医学基因组学国家重点实验室	20	110	6.0	9.0
4	李晖		62	599	15.0	21.0
5	邹丽容		26	130	8.0	10.0