跨膜蛋白结构预测新方法

• 作者: 丁兰 刘宏德 刘秀辉 卢小泉 王睿 陈晶
• 来源期刊: 科学通报
• 学科: 生物学
• 关键词: 连续小波变换极大值谱(MSCWT) 膜蛋白 跨膜区
• 年，卷（期）: 2007,（23）
• 所属期刊栏目: 论文
• 页码范围: 2742-2745
• 页数: 4页
• 分类号: Q5
• 字数: 3971字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0023-074x.2007.23.008

摘要

基因组数据中大约有20%～30%的基因产物被预测为膜蛋白,膜蛋白是一类具有重要生物功能的蛋白质.预测膜蛋白跨膜区的数量和位置是生物信息学中重要的研究课题.提出了一种预测膜蛋白跨膜区的新方法--连续小波变换极大值谱(MSCWT).该法对8种SARS-CoV膜蛋白的预测准确度与常用膜蛋白预测软件TMpred相当,对MPtopo数据库中131种新的已知结构的螺旋束蛋白(共包含548个跨膜区)的预测显示,其跨膜螺旋区预测准确率为91.6%,膜蛋白序列的预测准确率为89.3%.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	卢小泉	西北师范大学化学化工学院	92	897	16.0	27.0
2	丁兰	西北师范大学生命科学学院	110	1451	19.0	31.0
3	刘秀辉	西北师范大学化学化工学院	26	476	9.0	21.0
4	陈晶	西北师范大学化学化工学院	18	316	8.0	17.0
5	刘宏德	西北师范大学化学化工学院	7	201	4.0	7.0
6	王睿	西北师范大学化学化工学院	9	35	4.0	5.0