基于相互作用的蛋白质功能预测

• 作者: 张振慧 王勇献 王正华 王秀鹤
• 来源期刊: 激光生物学报
• 学科: 工学
• 关键词: 蛋白质功能预测 蛋白质相互作用 小世界网络
• 年，卷（期）: 2007,（4）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 390-393
• 页数: 4页
• 分类号: Q811|TP391
• 字数: 3780字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-7146.2007.04.002

摘要

蛋白质功能预测是后基因时代研究的热点问题.基于相互作用的蛋白质功能预测方法目前应用比较广泛,但是当"伙伴蛋白质"(interacting partners)数目κ较小时,其预测准确率不高.从蛋白质相互作用网络入手,结合"小世界网络"特性,有效解决了κ较小时预测准确率不高的问题.对酵母(Saccharomyces cerevisiae)蛋白质的相互作用网络进行预测,当κ≤4时其预测准确率比相同条件下的GO(global optimization)方法有一定提高.实验结果表明:该方法能够有效的应用于伙伴蛋白质数目较小时的蛋白质功能预测.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王正华	国防科技大学并行与分布处理国家重点实验室	72	600	12.0	20.0
2	王勇献	国防科技大学并行与分布处理国家重点实验室	26	140	7.0	11.0
3	张振慧	国防科技大学并行与分布处理国家重点实验室	17	82	6.0	8.0
4	王秀鹤	国防科技大学并行与分布处理国家重点实验室	2	14	2.0	2.0