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摘要:
目的 表达日本血吸虫(Schistosoma japonicum)转录本组中筛选获得的候选抗原基因Th细胞表位,以备免疫试验验证,为建立大规模、高通量、快速鉴定日本血吸虫Th细胞表位的方法奠定基础.方法 应用数据挖掘技术,按照序列在不同期别转录本的数量,从Feng Liu等公布的转录本组EST序列中筛选出期别差异表达基因,选择具有完整可读框的序列作为抗原候选基因,其所编码蛋白按照有无信号肽和跨膜结构分为:信号肽跨膜结构组、非信号肽、跨膜结构组序列组.对编码蛋白应用表位预测服务器PRED-BALB/c、SYFPEIT、MHCPred、Rankpep分别对I-Ad、I-Ed、I-Ak、I-Ek型MHC分子进行表位预测.各期别各组筛选出5条最优混合预测表位.选择童虫期信号肽和跨膜结构组(mep1)和非信号肽、跨膜结构组序列组(mep2)的各5条最优15肽表位,分别设计并合成其编码核苷酸,克隆到原核表达载体pET-28a(+)进行表达、纯化.结果 筛选到不同期别差异表达基因166条.表位预测后,总共筛选出40条最优混合表位,各期别各组5条.将童虫期目的基因mep1和mep2成功合成和克隆到了表达载体pET-28a(+),目的基因mep1表达量很高,而mep2未见表达,纯化得到mep1表达蛋白.结论 成功表达了串连抗原表位,为进一步分析其免疫原性、鉴定出有效表位做好了准备.
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内容分析
关键词云
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文献信息
篇名 日本血吸虫期别差异基因的Th细胞表位预测及串连多表位的原核表达
来源期刊 中国兽医寄生虫病 学科 农学
关键词 日本血吸虫 转录本组 Th细胞表位 预测 表达
年,卷(期) 2007,(5) 所属期刊栏目 研究论文
研究方向 页码范围 1-6
页数 6页 分类号 S852.735
字数 4657字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1674-6422.2007.05.001
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研究主题发展历程
节点文献
日本血吸虫
转录本组
Th细胞表位
预测
表达
研究起点
研究来源
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研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国动物传染病学报
双月刊
1674-6422
31-2031/S
大16开
上海市闵行区紫月路518号
1993
chi
出版文献量(篇)
2151
总下载数(次)
1
总被引数(次)
8579
相关基金
国家高技术研究发展计划(863计划)
英文译名:The National High Technology Research and Development Program of China
官方网址:http://www.863.org.cn
项目类型:重点项目
学科类型:信息技术
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