杜氏盐藻psaB基因cDNA克隆及系统进化分析

• 作者: 刘红涛 臧卫东 薛乐勋 鲁照明
• 来源期刊: 广西植物
• 学科: 生物学
• 关键词: 杜氏盐藻 A2亚基 psaB cDNA 简并引物
• 年，卷（期）: 2007,（2）
• 所属期刊栏目: 植物生理与分子生物学
• 页码范围: 224-230,235
• 页数: 8页
• 分类号: Q943
• 字数: 1458字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-3142.2007.02.016

摘要

根据真核生物莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)、Chlamydomonas moewusii及Chlorella vulgaris等光系统I反应中心蛋白psaB基因的氨基酸高度保守序列,设计一对简并引物,利用TRIzol试剂提取杜氏盐藻(Dunaliella salina)细胞的总RNA,通过RT-PCR,得到的一段长为1.8 kb左右的cDNA片段.PCR产物经T-A克隆并测序以及测序结果推导成氨基酸序列进行同源性比较,表明所克隆的1815bp序列为杜氏盐藻光系统I反应中心psaB基因的cDNA片段,GenBank收录号为AY820754.根据已经得到的psaB的核苷酸序列推导成氨基酸序列与一些已知物种的psaB氨基酸序列相比较,同源性分别为Chlamydomonas reinhardtii 92%,Chlamydomonas moewusii 91%,Chlorella vulgaris 86%,Mesostigma viride 85%,Physcomitrella patens subsp.Patens 85%,Nephroselmis olivacea 84%.此外,psaB密码子偏爱性分析表明:杜氏盐藻psaB基因第三位密码子A和T的组成分别为35.7%和39.17%,而G和C分别为7.27%和17.85%,即杜氏盐藻psaB基因密码子的组成大多为NNA和NNT.根据psaB基因的特征,作者对绿藻门的50个物种的psaB基因作了进化分析,结果表明.杜氏盐藻与Haematocoecaceae中的大多数种类进化地位最为接近,这为更进一步弄清杜氏盐藻的遗传背景提供了理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	薛乐勋	郑州大学细胞生物学研究室	140	1187	18.0	26.0
2	臧卫东	郑州大学细胞生物学研究室	91	279	8.0	10.0
3	刘红涛	郑州大学细胞生物学研究室	60	431	11.0	18.0
4	鲁照明	郑州大学细胞生物学研究室	29	112	6.0	9.0