鸭MHCⅠ轻链cDNA克隆及其蛋白的二级结构分析

• 作者: 夏春 蒋一男 郝慧芳 阮小飞 陈卫红 高凤山
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鸭 β2微球蛋白 二级结构 同源模建
• 年，卷（期）: 2007,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 41-45
• 页数: 5页
• 分类号: S188
• 字数: 2772字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2007.01.010

摘要

为了阐明鸭主要组织相容性复合体Ⅰ(MHC Ⅰ)的结构并推进其功能研究,采用Full RACE PCR法从鸭淋巴细胞cDNA文库中克隆了鸭MHCⅠ轻链(Anpl-β2m)cDNA,GenBank登陆号为AB246408.随后,采用pMAL-p2X/E.coli TB1原核表达系对Anpl-β2m成熟肽基因进行了可溶性表达,表达的融合蛋白命名为MBP-β2m.融合蛋白经过Amylose树脂亲和层析纯化、Western blot分析和蛋白酶切割后,用圆二色谱测定了其二级结构,并同源模建了Anpl-β2m蛋白的三级结构(3D).cDNA克隆结果显示Anpl-β2m cDNA长792bp,包含18bp 5'端和414bp 3'端非翻译区.其ORF为119个氨基酸(aa),包含20aa信号肽和99aa成熟肽.成熟肽序列的第25位和80位为半胱氨酸(C),第80位半胱氨酸附近的"YTCRVDH"序列与免疫球蛋白超基因家族的特征基序"YxCxVxH"相符.氨基酸序列与鸡、鱼、蛙、人和鼠等的β2m基因比较,同源性30.3%～65.9%之间.圆二色谱测定结果显示Anpl-β2m蛋白呈典型的β折叠结构,α螺旋、β折叠、转角和随机卷曲含量分别为0、50、23和26.同源模建显示Anpl-β2m蛋白三级结构(3D)与人和小鼠β2m 3D结构类似,由7个β片层组成,不含α螺旋.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	夏春	中国农业大学动物医学院	68	1187	22.0	31.0
2	高凤山	中国农业大学动物医学院	10	57	5.0	7.0
3	郝慧芳	中国农业大学动物医学院	7	31	4.0	5.0
4	阮小飞	中国农业大学动物医学院	3	46	3.0	3.0
5	蒋一男	中国农业大学动物医学院	5	40	5.0	5.0
6	陈卫红	中国农业大学动物医学院	1	5	1.0	1.0