植物法呢基焦磷酸合成酶的生物信息学分析

• 作者: 李嵘 王喆之
• 来源期刊: 热带亚热带植物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 植物萜类合成 法呢基焦磷酸合成酶 生物信息学
• 年，卷（期）: 2007,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 126-134
• 页数: 9页
• 分类号: Q71
• 字数: 4813字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-3395.2007.02.006

摘要

采用生物信息学的方法和工具对已在GenBank上注册的番茄(Lycopersicon esculentum)、橡胶(Hevea brasiliensis)、香蕉(Musa acuminata)、苹果(Malus×domestica)、向日葵(Helianthus annuus)、葡萄(Vitis vinifera)等的法呢基焦磷酸合成酶的核苷酸及氨基酸序列进行分析,并对其组成成分、转运肽、跨膜拓朴结构域、疏水性/亲水性、蛋白质二级及三级结构、分子系统进化关系等进行预测和推断.结果表明:该酶基因的全长包括5'、3'非翻译区和一个开放阅读框;其编码的蛋白是一个无跨膜结构域、不具转运肽的亲水性蛋白,包括5个保守的结构motif,其中两个是富含天冬氨酸(Asp)的motif,α-螺旋和不规则盘绕是蛋白质二级结构最大量的结构元件,β-转角和延伸链散布于整个蛋白质中,蛋白质的功能域在空间布局上是由α-螺旋围绕形成的中间具一个"大空穴"的立体结构,"大空穴"的表面藏有五个功能保守motif,其中两个Asp-motif位于"空穴"的内壁.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王喆之	陕西师范大学生命科学学院	155	1966	25.0	35.0
2	李嵘	陕西师范大学生命科学学院	6	168	5.0	6.0