甲烷八叠球古菌及其他广古菌同义密码子使用偏好性

• 作者: 吴昊男 江澎 笪遥 陆祖宏 魏镓伟
• 来源期刊: 东南大学学报（英文版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 密码子使用偏好性 密码子使用相对概率(RSCU) 甲烷八叠球古菌
• 年，卷（期）: 2007,（2）
• 页码范围: 289-293
• 页数: 5页
• 分类号: Q617
• 字数: 468字
• 语种: 英文
• DOI: 10.3969/j.issn.1003-7985.2007.02.027

摘要

比较分析了甲烷八叠球古菌(Methanosarcina mazei str.Goe1)和其他2种系统发育相关的广古细菌(嗜苦古菌(Picrophilus torridus str.DSM 9790)和盐碱古菌(Natronomonas pharaonis str.DSM 2160))的同义密码子使用偏好性.结果表明甲烷八叠球古菌的密码子使用偏好性很小,并且与GC3S值有很高的相关性.这3种广古细菌的密码子使用模式在进化上很保守.通过分层聚类分析,得出较之基因功能对密码子使用的影响,这些广古菌密码子的使用更是由其物种所决定的.考虑到这3个物种生活在pH值差异很大的环境中,推测其生活环境在很大程度上决定了这些微生物密码子的使用方式.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陆祖宏	东南大学生物电子学国家重点实验室	166	1602	19.0	33.0
2	吴昊男	东南大学生物电子学国家重点实验室	1	2	1.0	1.0
3	笪遥	东南大学生物电子学国家重点实验室	1	2	1.0	1.0
4	魏镓伟	东南大学生物电子学国家重点实验室	1	2	1.0	1.0
5	江澎	东南大学生物电子学国家重点实验室	4	18	2.0	4.0