9株猪圆环病毒Ⅱ型流行毒株全基因组克隆及序列分析

• 作者: 余克伦 刘海鹏 刘芳 尹业师 屈素洁 廖素环 温荣辉 罗廷荣 谢丽华 陆芹章 黄伟坚
• 来源期刊: 广西农业生物科学
• 学科: 农学
• 关键词: 猪圆环病毒Ⅱ型 全基因组 同源性 变异
• 年，卷（期）: 2007,（2）
• 所属期刊栏目: 生物技术专栏
• 页码范围: 101-105
• 页数: 5页
• 分类号: S852.659.2|S828
• 字数: 3581字
• 语种: 中文

摘要

参考GenBank上发表的猪圆环病毒Ⅱ型(porcine circovirus 2 ,PCV2)全基因组序列,设计一对引物,通过反向PCR技术扩增出9株PCV2流行株的全基因,并进行了序列测定与分析,结果表明:9株PCV2的基因组全长为1 768 bp或1 767 bp,同源性比较发现,本研究的9株PCV2之间的核苷酸同源性为95.6%～100%,与GenBank上已发表的PCV2分离株之间的同源性为95.1%～99.8%,与法国和新西兰代表株的亲缘关系较近,与美国、加拿大和澳大利亚代表株的亲缘关系较远.所得9株PCV2的ORF2核苷酸及其所推导的氨基酸序列同源性分别为93.1%～100%和91.8%～99.6%,存在较大的变异.