家蚕地方品种线粒体基因组A+T丰富区的序列及分子进化分析

• 作者: 唐顺明 张国政 张志芳 徐安英 沈兴家 赵巧玲 郭锡杰 陈丽媛
• 来源期刊: 蚕业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 家蚕 线粒体DNA A+T丰富区 分子进化 起源
• 年，卷（期）: 2007,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 5-13
• 页数: 9页
• 分类号: S881.2|Q78
• 字数: 5805字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0257-4799.2007.01.002

摘要

为了研究家蚕线粒体基因组A+T丰富区的结构和家蚕品种的进化,用PCR方法扩增了12个家蚕(Bombyx mori)地方品种线粒体基因组A+T丰富区及其侧翼序列,分离纯化后克隆到pMD18-T载体进行测序.序列分析表明,克隆片段长度约1.1 kb,基因排列顺序与C108 线粒体相同,依次为12S rRNA基因3'端、A+T丰富区、tRNAMet、tRNAIle、tRNAGln和ND2基因5'端,在tRNAGln和ND2基因之间有47 bp的非编码区.以日本野桑蚕(Bombyx mandarina)为外群,用Phylip软件包构建了基于12个家蚕品种线粒体基因组A+T丰富区序列的NJ进化树.结果显示,甘肃种单独聚为一群,其进化早于其它11个品种聚成的类群,说明甘肃种是供试家蚕品种中进化最早的品种.这一结果在分子水平上为黄河流域是家蚕品种的发祥地之一提供了证据,也进一步支持了家蚕品种的中国起源说.对A+T丰富区及其侧翼基因的结构分析表明,家蚕线粒体12S rRNA和ND2基因都十分保守,14个品种统计只分别发生1个和2个碱基转换;A+T丰富区中(A+T)比例高达94.9%以上,第27 nt开始有1个T-串结构,长度为16～19 bp不等;同时还根据3个tRNA基因的核苷酸序列推定了其二级结构.