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华支睾吸虫乳酸脱氢酶(CsLDH)基因的识别及其结构与功能分析
华支睾吸虫乳酸脱氢酶(CsLDH)基因的识别及其结构与功能分析
作者:
余新炳
吕刚
徐劲
胡旭初
黄灿
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
华支睾吸虫
乳酸脱氢酶
结构与功能
生物信息学
摘要:
目的 分析华支睾吸虫乳酸脱氢酶基因及其编码蛋白的结构和特性,用于指导其生物学功能的实验研究.方法 利用多种生物信息在线分析工具和分析软件包,从华支睾吸虫全长cDNA质粒文库的表达序列标签(EST)中识别乳酸脱氢酶(CsLDH)基因,预测该基因编码蛋白质的理化特性、氨基酸修饰位点、功能域、亚细胞定位、拓扑结构、二级结构、三维结构及酶学特性和免疫学特性等.结果 该基因全长1224bp,编码区为79~1062,编码328 aa,理论分子量为35 633 Mr,等电点为8.13,半衰期长,理化性质稳定,含有多个潜在的磷酸化和酯酰化位点.预测该蛋白有3个跨膜区,其拓扑结构为N端在膜内侧、C端在膜外侧.有两个主要的线性抗原表位aa10~aa30和aa94~aa102,后者位于膜外,与日本血吸虫LDH相应表位完全一致,与人和小鼠LDH相应表位仅有1个氨基酸差异.该表位中Arg102是酶催化中心的关键氨基酸之一,模拟三维结构显示组成催化中心的另外两个关键氨基酸残基Asp162和His189的空间位置也靠近该表位,酶的催化中心贯穿膜内外.结论 推测华支睾吸虫乳酸脱氢酶不仅负责将糖酵解产生的丙酮酸转化为乳酸,而且还能将乳酸直接排出体外:可作为筛选水溶性抗华支睾吸虫药物的靶标;可介导特异性抗体对虫体的ADCC作用和补体的杀伤作用,以及对酶活性的抑制作用,是一个重要的疫苗侯选抗原.
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文献信息
篇名
华支睾吸虫乳酸脱氢酶(CsLDH)基因的识别及其结构与功能分析
来源期刊
热带医学杂志
学科
医学
关键词
华支睾吸虫
乳酸脱氢酶
结构与功能
生物信息学
年,卷(期)
2007,(12)
所属期刊栏目
基础研究论著
研究方向
页码范围
1145-1148,封2
页数
5页
分类号
R383.22
字数
3659字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1672-3619.2007.12.001
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
余新炳
中山大学中山医学院寄生虫学教研室
201
1352
17.0
28.0
2
徐劲
中山大学中山医学院寄生虫学教研室
104
568
13.0
17.0
3
胡旭初
中山大学中山医学院寄生虫学教研室
108
574
13.0
17.0
4
吕刚
中山大学中山医学院寄生虫学教研室
54
174
6.0
10.0
8
黄灿
中山大学中山医学院寄生虫学教研室
22
139
6.0
11.0
传播情况
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节点文献
华支睾吸虫
乳酸脱氢酶
结构与功能
生物信息学
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
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相关学者/机构
期刊影响力
热带医学杂志
主办单位:
广东省寄生虫学会
中华预防医学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1672-3619
CN:
44-1503/R
开本:
大16开
出版地:
广州市中山二路74号中山医学院
邮发代号:
创刊时间:
1979
语种:
chi
出版文献量(篇)
7964
总下载数(次)
21
相关基金
国家高技术研究发展计划(863计划)
英文译名:
The National High Technology Research and Development Program of China
官方网址:
http://www.863.org.cn
项目类型:
重点项目
学科类型:
信息技术
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热带医学杂志2007年第11期
热带医学杂志2007年第10期
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