霍乱弧菌新类型溶源性噬菌体基因组结构研究

• 作者: 刘延清 祁国明 芮勇宇 阚飙 高守一
• 来源期刊: 中国公共卫生
• 学科: 医学
• 关键词: 霍乱弧菌 噬菌体 序列分析
• 年，卷（期）: 2007,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 406-408
• 页数: 3页
• 分类号: R183.4
• 字数: 2658字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1001-0580.2007.04.010

摘要

目的 研究霍乱弧菌埃尔托型(EVC)新类型溶源性噬菌体(CTXψ)和核心区不含ctxAB基因的溶源性噬菌体(nct-CTXψ)基因组的结构.方法 采用基因扩增、测序及序列生物信息学等方法进行观察与分析.结果 在我国EVC中,存在仅携带古典型(class)nct-CTXψ、CTXψ或埃尔托型(ET)CTXψ基因组类型,并发现nct-CTXclassψ和CTXETψ共存、nct-CTXnewETψ和CTXclassψ共存的新类型.CTXψ和nct-CTXψ基因组zot基因3'末端,60bp序列中40%位点不同,推测的氨基酸序列中60%位点不同.class、ET和newET类型ig1、rstR和ig2基因序列同源性分别为77.0%～97.4%,10.4%～17.9%,9.6%～64.8%,RstR同源性9.2%～24.1%.CTXψ基因组均位于染色体TLC基因簇附近.上述不同类型EVC的tcpA、TcpA、ctxA、ctxB、CtxA和CtxB与GenBank中EVC和0139群产毒株的同源性分别＞99%,99%,99%,98%,98%和96%.结论 首次在EVC中发现nct-CTXclassψ和CTXETψ、nct-CTXnewETψ和CTXclassψ共存的新类型.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	芮勇宇	南方医科大学南方医院检验科	118	541	11.0	13.0
2	阚飙	中国疾病预防控制中心传染病预防控制所	120	614	11.0	19.0
3	高守一	中国疾病预防控制中心传染病预防控制所	21	65	5.0	7.0
4	刘延清	中国疾病预防控制中心传染病预防控制所	8	32	3.0	5.0
5	祁国明	中国疾病预防控制中心传染病预防控制所	7	26	3.0	5.0