蛋白质的分组重量编码及在结构型预测的应用

• 作者: 张振慧 王勇献 王正华
• 来源期刊: 计算机工程与应用
• 学科: 生物学
• 关键词: 蛋白质序列 特征序列 组分耦联算法 结构型
• 年，卷（期）: 2007,（7）
• 所属期刊栏目: 学术探讨
• 页码范围: 38-40,89
• 页数: 4页
• 分类号: Q61
• 字数: 4170字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1002-8331.2007.07.012

摘要

从氨基酸的物化特性出发,利用物理学中"粗粒化"思想,提出了一种蛋白质序列的分组重量编码方法(Encoding Based on Grouped Weight,简记为EBGW),并结合组分耦联算法进行结构型预测的研究.对标准集T359中359个蛋白质的Resubstitution检验和Jack-knife检验预测准确性分别达到99.72%和91.09%,其中Jack-knife检验总体预测精度比相同条件下采用氨基酸组成编码的方法提高了约7%,特别是α+β类的预测精度提高了15%.实验结果表明蛋白质序列的EBGW编码方法能够有效地提取字母序列中蕴含的结构信息.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王正华	国防科技大学并行分布与处理国家重点实验室	72	600	12.0	20.0
2	王勇献	国防科技大学并行分布与处理国家重点实验室	26	140	7.0	11.0
3	张振慧	国防科技大学理学院	17	82	6.0	8.0