广州4株登革1型病毒E基因的全序列测定和分子进化分析

• 作者: 刘晓丽 周俊梅 周经姣 方丹云 梁瑜 江丽芳 陶剑平
• 来源期刊: 中华微生物学和免疫学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 登革病毒 E基因 序列分析 分子进化
• 年，卷（期）: 2008,（1）
• 所属期刊栏目: 病毒学
• 页码范围: 10-15
• 页数: 6页
• 分类号: R3
• 字数: 3967字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0254-5101.2008.01.003

摘要

目的 通过对广州市不同年份分离的4株登革1型病毒(DEN-1)蛋白E基因进行全序列测定及分子进化分析,了解各流行株之间的遗传差异及进化关系,追踪其可能的传染来源.方法 应用RT-PCR技术分别扩增各株病毒的蛋白E基因,克隆到pGEM-T Easy载体,转化DH5α宿主菌,经PCR和酶切鉴定后进行序列测定.测序结果与国内外流行株进行同源性比较和毒力位点分析,并绘制基因系统发生树.结果 4株DEN-1病毒E基因序列长度均为1485 bp,编码495个氨基酸,核苷酸序列同源性为91%～98%,推导的氨基酸序列同源性为96.0%～99.2%.广州1995年流行的DEN-1和2002、2004、2006年流行株的毒力位点氨基酸存在差异.结论 通过对登革1型病毒E基因的进化分析,GZ01/95、GZ01/02和GZ01/04这3株同属于基因型Ⅳ,而GZ17/06属于基因型Ⅰ.1995年广州地区流行的DEN-1可能来源于印度尼西亚,而2002和2004年的流行可能与澳大利亚流行株有关.2006年广州又出现的DEN-1可能与泰国2002年的流行株输入有关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	方丹云	中山大学中山医学院微生物学教研室	35	121	6.0	8.0
2	周经姣	中山大学中山医学院微生物学教研室	14	43	4.0	5.0
3	江丽芳	中山大学中山医学院微生物学教研室	68	274	7.0	12.0
4	陶剑平	中山大学中山医学院微生物学教研室	7	36	4.0	6.0
5	周俊梅	中山大学中山医学院微生物学教研室	17	67	4.0	7.0
6	梁瑜	中山大学中山医学院微生物学教研室	7	42	3.0	6.0
7	刘晓丽	中山大学中山医学院微生物学教研室	2	7	2.0	2.0