基于不同序列特征值预测氧化还原酶辅酶类型的研究

• 作者: 张光亚 方柏山 葛慧华
• 来源期刊: 计算机与应用化学
• 学科: 生物学
• 关键词: 特征值提取 氧化还原酶 辅酶 两性伪氨基酸组成 新氨基酸组成分布
• 年，卷（期）: 2008,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 545-548
• 页数: 4页
• 分类号: Q617
• 字数: 3360字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-4160.2008.05.008

摘要

如何有效提取蛋白质序列特征值,一直是生物信息学研究的重要任务.本文研究8种序列特征值提取方法,并考察它们在不同分类器中的表现,以用于预测氧化还原酶辅酶依赖类型.其中,氨基酸组成法效果最差,平均预测精度仅及64.96%;而将两性伪氨基酸组成和新氨基酸组成分布两种方法合并后,以支持向量机作为分类器时,其识别效果最佳,可达92.93%.此外,不同特征值的提取方法与分类器之间似乎有着一定的匹配关系,只有找到其间的最佳匹配,才能获得最佳的识别效果.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	方柏山	华侨大学工业生物技术研究所工业生物技术福建省高校重点实验室	137	975	15.0	23.0
2	张光亚	华侨大学工业生物技术研究所工业生物技术福建省高校重点实验室	88	491	10.0	20.0
3	葛慧华	华侨大学工业生物技术研究所工业生物技术福建省高校重点实验室	17	57	4.0	7.0