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摘要:
以兔抗鸭疫里默氏杆菌(RA)阳性血清对RA血清1型CH-1株表达型DNA文库中已通过蓝白斑筛选的一个阳性克隆进行了原位杂交筛选.经过5次免疫筛选后,阳性斑经过体内删除,噬菌粒经酶切分析和序列测定,得到一段4434bp的插入DNA片段.运用NCBI的BLASlN、BIASTP、ORF Finder、Conserved Domains、EMBL的FASTA等程序对该片段中的一个命名为ORF1689的开放阅读框架进行了全面的生物信息学分析.结果显示ORF1689起始密码子上游存在核糖体结合位点,完整ORF含1689bp,编码562个氨基酸,其编码蛋白的理论分子量为59.5kD,等电点为5.82.ORF1689具有phosphodiest蛋白家族的保守区域,与丙杆菌属的Caulobacter sp.K31、鞘氨醇单胞菌(Sphingomonas sp.)、Sphingopyxis alaskensis和Novosphingobium aromaticivorans的Ⅰ型磷酸二酯酶基因的氨基酸序列同源性分别为49.283%、38.716%、38.693%和38.313%,表明该基因是一种新的Ⅰ型磷酸二酯酶基因.该研究结果对阐明Ⅰ型磷酸二酯酶的生物学功能和RA的生理特性与致病机理提供了理论基础和实验数据.
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文献信息
篇名 鸭疫里默氏杆菌Ⅰ型磷酸二酯酶基因的发现及其分子特征分析
来源期刊 高技术通讯 学科 农学
关键词 鸭疫里默氏杆菌 Ⅰ型磷酸二酯酶 分子特征分析
年,卷(期) 2008,(4) 所属期刊栏目 资源环境与生物技术
研究方向 页码范围 436-440
页数 5页 分类号 S8
字数 4431字 语种 中文
DOI 10.3772/j.issn.1002-0470.2008.04.020
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 程安春 四川农业大学动物医学院禽病防治研究中心 128 1214 19.0 30.0
3 汪铭书 四川农业大学动物医学院禽病防治研究中心 97 986 18.0 28.0
9 朱德康 四川农业大学动物医学院禽病防治研究中心 13 82 4.0 9.0
10 陈虹 四川农业大学动物医学院禽病防治研究中心 4 24 3.0 4.0
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鸭疫里默氏杆菌
Ⅰ型磷酸二酯酶
分子特征分析
研究起点
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引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
高技术通讯
月刊
1002-0470
11-2770/N
大16开
北京市三里河路54号
82-516
1991
chi
出版文献量(篇)
5099
总下载数(次)
14
总被引数(次)
39217
相关基金
国家科技支撑计划
英文译名:
官方网址:http://kjzc.jhgl.org/
项目类型:重大项目
学科类型:能源
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