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大鼠卡氏肺孢子虫ITS 1-5.8S rDNA-ITS2的巢式PCR检测及基因序列的测定
大鼠卡氏肺孢子虫ITS 1-5.8S rDNA-ITS2的巢式PCR检测及基因序列的测定
作者:
张陆娟
张鸿满
林睿
欧阳颐
江河
赵同领
黎学铭
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
卡氏肺孢子虫
内转录问隔区(ITS)
5.8S核糖体RNA基因(5.8S rDNA)
巢式PCR
摘要:
目的 探讨ITS1-5.8S rDNA-ITS2巢式PCR检测卡氏肺孢子虫的应用价值并测定其基因序列.方法 采用地塞米松免疫抑制法诱导SD大鼠感染肺孢子虫;制作肺印片、肺组织匀浆液及支气管肺泡灌洗液(BAL)涂片进行六亚甲基四胺银(GMS)染色镜检;提取肺孢子虫DNA进行巢式PCR扩增,测序后与GenBank的不同宿丰肺孢子虫相关序列进行比较分析.结果 用ITS1-5.8S rDNA-ITS2巢式PCR法均能检测出实验感染大鼠BAL和肺组织卡氏肺孢子虫DNA,阳性率为100%(10/10),比较BAL标本、肺印片和肺组织匀浆液GMS染色法的检出效率,BAL最低,肺组织匀浆液最高.其中20%(2/10)大鼠的BAL标本用GMS染色法未能检测出,但用巢式PCR方法 均能成功扩增;所测SD大鼠卡氏肺孢子虫ITS1-5.8S rDNA-ITS2基因序列长度为516bp,ITS1、5.8S rDNA、ITS2基因片段分别为198、158、160bp,与GenBank的大鼠(L27658)、小鼠(AY532651)和长爪沙鼠(AY875972)的ITS1-5.8S rDNA-ITS2基因的同源性分别为96%(452/467)、88%(275/310)、95%(152/159),其变异位点多在ITS1和ITS2基因片段.结论 ITS1-5.8S rDNA-ITS2巢式PCR检测卡氏肺孢子虫敏感性高、特异性强,可作为早期诊断肺孢子虫肺炎方法,特别适用无创性标本的检测;成功获取SD大鼠卡氏肺孢子虫ITS1-5.8S rDNA-ITS2的基冈序列,与不同宿主比较其5.8S rDNA较保守,ITS1和ITS2基因变异较大,适合基因分型和系统进化研究.
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文献信息
篇名
大鼠卡氏肺孢子虫ITS 1-5.8S rDNA-ITS2的巢式PCR检测及基因序列的测定
来源期刊
应用预防医学
学科
医学
关键词
卡氏肺孢子虫
内转录问隔区(ITS)
5.8S核糖体RNA基因(5.8S rDNA)
巢式PCR
年,卷(期)
2008,(5)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
257-262
页数
6页
分类号
R382.3
字数
2533字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1673-758X.2008.05.001
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
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1
黎学铭
57
261
9.0
13.0
2
江河
32
134
6.0
8.0
3
林睿
29
156
7.0
11.0
4
赵同领
2
3
1.0
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张鸿满
48
248
9.0
12.0
6
张陆娟
18
45
4.0
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欧阳颐
31
111
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传播情况
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节点文献
卡氏肺孢子虫
内转录问隔区(ITS)
5.8S核糖体RNA基因(5.8S rDNA)
巢式PCR
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
应用预防医学
主办单位:
广西壮族自治区疾病预防控制中心
出版周期:
双月刊
ISSN:
1673-758X
CN:
45-1345/R
开本:
大16开
出版地:
广西省南宁市金洲路18号
邮发代号:
创刊时间:
1995
语种:
chi
出版文献量(篇)
4183
总下载数(次)
2
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