HSV-2的生物信息学分析及其探针设计的探讨

• 作者: 张建华 张芳琳 王海涛
• 来源期刊: 山西医科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 单纯疱疹病毒2型 Matlab7.0 BLAST Oligo探针
• 年，卷（期）: 2008,（7）
• 所属期刊栏目: 基础医学
• 页码范围: 582-584
• 页数: 3页
• 分类号: R318.04
• 字数: 2237字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-6611.2008.07.002

摘要

目的 利用生物信息学分析单纯疱疹病毒2型(HSV-2)基因序列的特点,设计HSV-2诊断芯片的Oligo探针. 方法 利用Matlab7.0和ANTHEPROTV5对HSV-2序列进行分析,并通过BLAST软件对HSV-2的DNA序列进行序列比对,得到有意义的特异序列;用生物学软件Oligo6.0设计特异性高、Tm值相近、长度均一的Oligo探针. 结果 利用Madab7.0和ANTHEPROT V5分析HSV-2二级结构的分布以及其理化性质,同时生物学软件Olig06.0获得13条60-merOligo探针.结论通过生物信息学设计HSV-2诊断芯片的探针,可为后期打印成DNA芯片,用于HSV-2的检测打下基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张芳琳	第四军医大学基础部微生物教研室	76	353	10.0	14.0
2	王海涛	第四军医大学基础部微生物教研室	28	97	6.0	8.0
3	张建华	郑州大学生物医学工程系	87	604	15.0	20.0