生物信息学分析亚洲牛带绦虫WD40基因及其蛋白质的结构与功能

• 作者: 余新炳 包怀恩 廖兴江 徐劲 杜武英 胡旭初 郎书源 黄江
• 来源期刊: 热带医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 亚洲牛带绦虫 WD40 结构与功能 生物信息学
• 年，卷（期）: 2008,（7）
• 所属期刊栏目: 基础研究论著
• 页码范围: 642-645,663
• 页数: 5页
• 分类号: R383.32
• 字数: 3465字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-3619.2008.07.003

摘要

目的 分析和预测亚洲牛带绦虫WD40基因及其编码蛋白的结构和特性,用于指导其生物学功能的实验研究.方法 利用美国国家生物技术信息中心(NCBI,http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)、瑞士生物信息学研究所的蛋白分析专家系统(ExPASY,http://ca.expasy.org/)和IEDB Analysis Recource提供的各种生物信息学在线分析程序.结合其它生物信息学分析软件包如Pcgene和Vector NTI suite,从亚洲牛带绦虫全长cDNA质粒文库中识别WD40基因及其编码区,分析、预测该基因编码的蛋白质的理化特性、翻译后的修饰位点、功能域、亚细胞定位、拓扑结构、二级结构、三维空间构象等.结果 该基因全长1 208 bp,编码区为81～1 056 bp,编码402个氨基酸,为全长基因;无跨膜区,具有多个磷酸化位点,蛋白的理化性质稳定,理论分子量为35 942.4;没有质体、线粒体定位序列;预测该蛋白表面有三个亲水性强的线性表位和三个B细胞抗原表位.结论 应用生物信息方法从亚洲牛带绦虫成虫cDNA文库中识别出了亚洲牛带绦虫WD40基因,并对其所编码的蛋白质的结构与功能进行了预测.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郎书源	贵阳医学院寄生虫学教研室	47	431	11.0	19.0
2	包怀恩	贵阳医学院寄生虫学教研室	110	773	14.0	22.0
3	余新炳	中山大学中山医学院寄生虫学教研室	201	1352	17.0	28.0
4	徐劲	中山大学中山医学院寄生虫学教研室	104	568	13.0	17.0
5	胡旭初	中山大学中山医学院寄生虫学教研室	108	574	13.0	17.0
6	黄江	贵阳医学院寄生虫学教研室	76	329	11.0	14.0
7	廖兴江	贵阳医学院寄生虫学教研室	46	215	8.0	12.0
8	杜武英	贵阳医学院寄生虫学教研室	5	24	3.0	4.0