香蕉抗病种质RLK-RGAs的克隆与序列差异分析

• 作者: 向旭 孟祥春 徐金刚 蔡礼鸿 黄秉智
• 来源期刊: 农业科技通讯
• 学科: 农学
• 关键词: 香蕉 抗病种质 类受体蛋白激酶 抗病基因同源序列
• 年，卷（期）: 2008,（8）
• 所属期刊栏目: 试验研究
• 页码范围: 80-84
• 页数: 5页
• 分类号: S6
• 字数: 4556字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-6400.2008.08.034

摘要

利用其他植物抗病基因PK类保守域的9个结构域所设计简并引物,从抗镰刀菌枯萎病香蕉种质ROSE和GCTCV-119中分离了20个香蕉RGA片段,大小为530bp左右,其中14条DNA片段和6条cDNA片段.根据其推断的氨基酸序列,经过保守结构域分析,其结构域为S_TKc,为丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶家族成员,包含4功能域,分别为ATP binding pocket,substrate binding pocket,catalytic loop和activation loop.具有9个高度保守的氨基酸区域:Ⅰ.FG(K/V/L/S)VY(K/R)G;Ⅱ.VAVK;Ⅲ.FxxE;Ⅳ.(L/V/I)Vx(I/V/L);Ⅴ.ALV;Ⅵ.D(L/I/V)K;Ⅶ.DFG;Ⅷ.G(T/S)xGY(L/I/A)PE;Ⅸ.D(Y/I)YS-(F/Y)G(V/I/M).将这20条RGAs序列分别命名为Mu-PK1,Mu-PK2,……,Mu-PK20,并提交GenBank,获得登录号分别为EU293391-EU293404(DNA片段),EU338457-EU338462(cDNA片段).

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	蔡礼鸿	华中农业大学园艺林学学院	14	236	5.0	14.0