N-乙酰鸟氨酸脱酰基酶的生物信息学分析

• 作者: 李环 翁秋萍 韦萍
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 生物学
• 关键词: PagE基因 N-乙酰鸟氨酸脱酰基酶 结构与功能 生物信息学
• 年，卷（期）: 2008,（10）
• 所属期刊栏目: 植物生理·生化
• 页码范围: 4059-4061
• 页数: 3页
• 分类号: Q556
• 字数: 2851字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0517-6611.2008.10.026

摘要

[目的]对ArgE蛋白的结构和功能进行初步预测.[方法]以在GenBank上查找到的若干微生物N-乙酰鸟氨酸脱酰基酶基因序列为分析对象,以ArgE(P23908)为研究对象,利用生物信息学在线软件ORF finder、ProtParam和Protscale等对ArgE编码的蛋白N-乙酰鸟氨酸脱酰基酶的二级结构和特殊结构、序列同源性、结构域及功能位点进行了初步预测.[结果]ArgE蛋白是一种酸性可溶性蛋白,理论等电点为5.54,分子量为42 347.3,无信号肽,为非分泌蛋白,有多个磷酸化位点.蛋白中存在α螺旋、β-折叠和无规则卷曲结构,有2个可形成跨膜结构的片段,不存在卷曲螺旋,也无线粒体定位信号.ArgE蛋白与CBPG、DAPE、ACY1、YSCS几种蛋白具有较高的相似性.[结论]该研究可为ArgE蛋白的结构和功能的实验研究提供理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	韦萍	南京工业大学制药与生命科学学院	359	3120	25.0	38.0
2	李环	南京工业大学制药与生命科学学院	39	236	8.0	13.0
3	翁秋萍	南京工业大学制药与生命科学学院	4	21	2.0	4.0