鲤与生长性状相关的EST-SSRs标记筛选

• 作者: 孙效文 常玉梅 张晓峰 张研 曹顶臣 李鸥 顾颖 鲁翠云
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 鲤 EST-SSRs 生长性状 BLAST 冷诱导基因RNA结合蛋白 DAZ相关蛋白1 核糖体蛋白L6
• 年，卷（期）: 2009,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 15-22
• 页数: 8页
• 分类号: Q959
• 字数: 5192字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1005-8737.2009.01.003

摘要

以大头鲤(Cyprinus pellegrini Tchang)(母本)与荷包红鲤(Cyprinus carpio wuyuanensis)抗寒品系(父本)杂交产生的F1作为亲本,以其自交F2作为分离群体,结合"拟测交"策略,用EST-SSRs标记对其中92个个体进行基因型检测.利用Windows Map Manager 2.0的标记回归法对符合拟测交分离的70个EST-SSRs标记进行单标记回归分析,检测出8个与鲤体长、体高、体厚性状相关的标记.对同一标记不同基因型个体间生长性状进行显著性比较,通过t检验,找到与生长性状相关的基因型.将上述8个EST序列与GenBank数据库进行BLAST比对,有3条EST序列与蛋白库中已知功能的序列高度同源.其中HLJE225与编码斑马鱼(J9enio rerio)冷诱导基因RNA结合蛋白的基因同源性水平高达97%,HLJE222与编码斑马鱼DAZ相关蛋白1基因同源性水平也高达97%,HLJE599与编码斑点叉尾鲴(Ictalurus punctatus)核糖体蛋白L6基因的同源水平为87%.本研究鉴定的与鲤生长性状相关的功能基因及有利用价值的基因型,为鲤重要生长性状的QTL(数量性状基闪座)定位和分子标记辅助育种提供了一定的依据.[中国水产科学,2009,16(1):15-22]