花生栽培种EST-SSRs分布特征及应用研究

• 作者: 刘海燕 周桂元 李少雄 梁炫强 洪彦彬 温世杰 陈小平
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 花生栽培种 EST SSR 开发
• 年，卷（期）: 2009,（2）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 246-254
• 页数: 9页
• 分类号: S5
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2009.00246

摘要

利用自行开发的20 160条花生栽培种荚果EST,通过序列拼接,获得8 289条无冗余EST.经搜索,共检测出740个SSR位点,分布于651条EST中,发生频率为7.8%,平均每6.8 kb EST序列含一个SSR位点.功能注释结果表明具生物过程、分子功能和细胞组分的EST分别为73、111和56条.在花生荚果EST-SSR中,三核苷酸重复类型出现频率最高,占总SSR的62.8%,其次是二核苷酸重复类型,占总SSR的33.6%.在出现的26类重复基序中,AG/TC重复基序出现频率最高,AAG/TTC次之.利用Primer premier 5从651条含有SSR的EST中共设计引物233对,从中随机选取100对引物检测EST-SSR在花生栽培种中的多态性及在野生种中的可转移性.结果表明,有86对引物在供试的22个花生栽培品种中得到有效扩增,其中lO对在栽培种中具有多态性,每对引物检测出的等位基因数2～3个,平均2.2个.可扩增引物在野生种中的可转移率为12.5%～100.0%,平均96.0%.在野生种间检测出多态性的引物76对.每对引物检测出等位基因2～9个,平均4.06个.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李少雄	广东省农业科学院作物研究所	54	542	14.0	21.0
2	梁炫强	广东省农业科学院作物研究所	111	1027	19.0	27.0
3	周桂元	广东省农业科学院作物研究所	80	854	17.0	26.0
4	洪彦彬	广东省农业科学院作物研究所	32	412	12.0	19.0
5	陈小平	广东省农业科学院作物研究所	23	279	8.0	16.0
6	刘海燕	广东省农业科学院作物研究所	32	327	10.0	17.0
7	温世杰	广东省农业科学院作物研究所	20	227	6.0	15.0