胡麻EST-SSRs标记分布特征及PCR反应体系的优化

• 作者: 党占海 党照 张建平 李闻娟 王利民 赵利 赵玮
• 来源期刊: 甘肃农业科技
• 学科: 农学
• 关键词: 胡麻 EST-SSR标记 PCR反应体系 优化
• 年，卷（期）: 2016,（10）
• 所属期刊栏目: 试验研究
• 页码范围: 1-5
• 页数: 5页
• 分类号: S565.9
• 字数: 3723字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-1463.2016.10.001

摘要

从美国NCBI数据库中下载了286868条亚麻EST，利用SSRIT软件检索出符合要求的SSR重复序列4310条，占整个EST数据库的1.50%。其中三核苷酸出现频率最高，占总SSR的40.09%； SSR重复类型总共235种，序列中占总SSR比例大于1%的重复类型共有21种，占SSR序列总数的68.63%。通过正交设计（L16）得到了胡麻EST-SSR最佳PCR反应体系：即20μL反应体系里，引物0.2μmol/L、模板DNA 50 ng、 dNTP 0.10 mmol/L、Mg2+1.5 mmol/L、 Taq DNA聚合酶0.50 U/μl、2μL 10×buffer，其余用ddH2O补齐。并通过单因素优化试验，对得到的胡麻EST-SSR最佳PCR反应体系进行了验证，结果完全一致。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵玮	甘肃省农业科学院作物研究所	45	256	10.0	14.0
2	党占海	甘肃省农业科学院作物研究所	58	537	14.0	20.0
3	张建平	甘肃省农业科学院作物研究所	69	546	13.0	20.0
4	王利民	甘肃省农业科学院作物研究所	49	306	11.0	15.0
5	赵利	甘肃省农业科学院作物研究所	38	362	10.0	18.0
6	党照	甘肃省农业科学院作物研究所	32	185	8.0	12.0
7	李闻娟	甘肃省农业科学院作物研究所	19	83	6.0	8.0