我国鸭肝炎病毒分离株基因组的测定与分析

• 作者: 于可响 宋敏训 廖明 辛朝安 马秀丽
• 来源期刊: 华南农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鸭病毒性肝炎病毒(DHV) 分离株 基因组测序 基因组分析
• 年，卷（期）: 2009,（1）
• 所属期刊栏目: 动物科学与兽医学
• 页码范围: 74-80
• 页数: 7页
• 分类号: S852.65
• 字数: 4281字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-411X.2009.01.018

摘要

对我国鸭病毒性肝炎病毒(Duck hepatitis virus,DHV)分离株YZ和CL的全基因组进行了序列测定分析.结果表明,2分离株的基因组全长分别为7 713 nt和7 709 nt,包括626 nt的5'UTR、6 747 nt的ORF、314 nt的3'UTR以及23 nt和19 nt的poly(A)尾.结构蛋白VP0含有保守的四肽CPRP,VP3的N端存在一段约20个氨基酸的碱性氨基酸富集区域;VP1缺少RGD(Arg-Gly-Asp)基序.DHV 2分离株存在3个不相关的2A蛋白基序,其中2A1蛋白类似口蹄疫病毒属的2A蛋白,2A2蛋白与AIGl蛋白(拟南芥)和GTPase更为相似,2A3蛋白则与副肠孤病毒属的2A2蛋白类型相似;2C蛋白含有保守基序EPxxxxxxGxxGxGK(S/T)、QxxxxxDDxxQ和KGxxxxSxxxxxS/T.3C蛋白含有催化三联体H38-D69-C144;3D蛋白包含KDELR、DxxxxD、GxxSGxxxTxxxNx、YGDD和FLKR等RNA聚合酶的特征基序.基于多聚蛋白、VP1、2C和3C蛋白的进化关系分析结果均表明,DHV分离株与副肠孤病毒属的遗传关系最近,但占据一个清晰的独立遗传谱系,应将DHV单独划属.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	宋敏训	山东省农业科学院家禽研究所	106	798	16.0	25.0
2	于可响	山东省农业科学院家禽研究所	37	184	7.0	12.0
3	马秀丽		43	483	11.0	20.0
7	廖明		2	7	1.0	2.0
8	辛朝安		1	7	1.0	1.0