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随机森林方法预测膜蛋白类型
随机森林方法预测膜蛋白类型
作者:
胡秀珍
袁敏
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
生物膜蛋白
随机森林法
离散增量
离散傅里叶谱
伪氨基酸组分
摘要:
膜蛋白的类型与其功能是密切相关的,因此膜蛋白类型的预测是研究其功能的重要手段,从蛋白质的氨基酸序列出发对膜蛋白的类型进行预测有重要意义.文章基于蛋白质的氨基酸序列,将组合离散增量和伪氨基酸组分信息共同作为预测参数,采用随机森林分类器,对8类膜蛋白进行了预测.在Jackknife检验下的预测精度为86.3%,独立检验的预测精度为93.8%,取得了好于前人的预测结果.
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篇名
随机森林方法预测膜蛋白类型
来源期刊
生物物理学报
学科
生物学
关键词
生物膜蛋白
随机森林法
离散增量
离散傅里叶谱
伪氨基酸组分
年,卷(期)
2009,(5)
所属期刊栏目
生物信息学
研究方向
页码范围
349-355
页数
7页
分类号
Q61
字数
语种
中文
DOI
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
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1
胡秀珍
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离散傅里叶谱
伪氨基酸组分
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
生物物理学报
主办单位:
中国生物物理学会
中国科学院生物物理研究所
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-6737
CN:
11-1992/Q
开本:
大16开
出版地:
北京市朝阳区大屯路15号中国科学院生物物理研究所
邮发代号:
创刊时间:
1985
语种:
chi
出版文献量(篇)
1662
总下载数(次)
4
总被引数(次)
12572
相关基金
内蒙古自然科学基金
英文译名:
Natural Science Foundation of Neimenggu Province
官方网址:
http://www.btsti.com/policy/district/2005-1-27/20051271058235030.htm
项目类型:
辽宁省自然科学基金
学科类型:
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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