利用伪氨基酸组分预测分枝杆菌膜蛋白类型

• 作者: 丁辰 林昊 袁鲁峰 邓科君
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: 分枝杆菌 膜蛋白 伪氨基酸组分 支持向量机 方差分析
• 年，卷（期）: 2011,（3）
• 页码范围: 238-241
• 分类号: Q753
• 字数: 3738字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2011.03.015

摘要

膜蛋白是重要的药物靶位点,对膜蛋白类型的研究有助于药物的成功设计,因此正确预测膜蛋白类型对于药物研发是十分必要的.本文采用由274条分枝杆菌膜蛋白序列组成的一致性小于40%的数据集,以经过优化的伪氨基酸组分为特征,利用支持向量机分类算法预测分枝杆菌膜蛋白类型,在Jackknife检验下,得到85.4%的总体准确率和72.2%的平均准确率.结果说明,该方法可用于分枝杆菌膜蛋白类型的识别,将有助于抗分枝杆菌药物的开发.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邓科君	电子科技大学生命科学与技术学院	23	255	8.0	15.0
2	林昊	电子科技大学生命科学与技术学院	10	13	2.0	2.0
3	丁辰	电子科技大学生命科学与技术学院	1	1	1.0	1.0
4	袁鲁峰	电子科技大学生命科学与技术学院	1	1	1.0	1.0