利用伪氨基酸组分和支持向量机预测抗冻蛋白

• 作者: 许嘉
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: 抗冻蛋白 伪氨基酸组分 支持向量机
• 年，卷（期）: 2013,（4）
• 所属期刊栏目: 研究快报
• 页码范围: 297-299
• 页数: 3页
• 分类号: Q753
• 字数: 2472字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2013.04.10

摘要

抗冻蛋白是一类具有提高生物抗冻能力的蛋白质.抗冻蛋白能够特异性的与冰晶相结合,进而阻止体液内冰核的形成与生长.因此,对抗冻蛋白的生物信息学研究对生物工程发展,提高作物抗冻性有重要的推动作用.本文采用由400条抗冻蛋白序列和400条非抗冻蛋白序列构成数据集,以伪氨基酸组分为特征,利用支持向量机分类算法预测抗冻蛋白,对训练集预测精度达到91.3％,对测试集预测精度达到78.8％.该结果证明伪氨基酸组分能够很好的反映抗冻蛋白特性,并能够用于预测抗冻蛋白.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	许嘉	内蒙古科技大学分析测试中心	17	58	5.0	6.0