Solexa测序法研究肺炎克雷伯菌质粒基因组的耐药基因

• 作者: 包其郁 周铁丽 唐小丽 夏士林 李劲松 高升杰
• 来源期刊: 中华微生物学和免疫学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 肺炎克雷伯菌 质粒基因组 Solexa测序 SHV-ESBL
• 年，卷（期）: 2009,（12）
• 所属期刊栏目: 免疫检测
• 页码范围: 1140-1143
• 页数: 4页
• 分类号: R4
• 字数: 4290字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.0254-5101.2009.12.024

摘要

目的 通过Solexa高通量测序法研究肺炎克雷伯菌的质粒与耐药性的关系.方法 菌株为7年临床分离的206株肺炎克雷伯菌.提取所有菌的全部质粒DNA,Solexa高通量测序获得大规模的短序列.SOAP软件对质粒基因进行分析拼接,分析结果与相关数据库进行比对.MAQ软件分析质粒基因组包含的超广谱β-内酰胺酶(ESBL)多样性及单核苷酸多态性(SNP)情况.结果 肺炎克雷伯菌质粒基因组中已知的直接与耐药相关的基因就有13种.质粒基因组中存在多个ABC主动外排转运系统.发现4种编码β-内酰胺酶的ORF,其中SHV型ESBLs分布最广.系统分析了206株肺炎克雷伯菌质粒基因组中SHV型ESBLs的SNPs位点,发现存在着大量的非同义替换SNPs位点.结论 发现质粒中SHV型ESBLs基因可能受到选择压力,存在着大量的非同义替换SNPs位点.肺炎克雷伯菌质粒存在外排药物耐药方式,从而形成低水平的非特异多重耐药.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	包其郁	温州医学院生命科学学院生物系	43	206	8.0	12.0
2	周铁丽	温州医学院附属第一医院检验科	191	1618	21.0	27.0
3	李劲松	温州医学院生命科学学院生物系	18	109	5.0	10.0
4	高升杰	温州医学院生命科学学院生物系	1	4	1.0	1.0
5	夏士林	温州医学院生命科学学院生物系	1	4	1.0	1.0
6	唐小丽	温州医学院生命科学学院生物系	1	4	1.0	1.0