基于EST库的枳APETALA2基因cDNA克隆及其表达分析

• 作者: 上官凌飞 宋长年 房经贵 王晨 章镇
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 柑橘 枳 花器官发育 基因 表达分析
• 年，卷（期）: 2009,（6）
• 所属期刊栏目: 果树
• 页码范围: 799-806
• 页数: 8页
• 分类号: S666|Q78
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0513-353X.2009.06.004

摘要

根据物种间同源基因相对保守的特点,利用生物信息学方法以拟南芥APETALA2 cDNA序列作为模板,对柑橘EST数据库进行同源检索筛选,克隆了柑橘APETALA2基因的cDNA序列,并以枳[Poncirus trifoliata(L.)Raf.]花cDNA为模板,根据以上cDNA序列设计特异引物,利用RACE技术分别获得该基因的5'和3'末端,序列拼接后获得枳的APETALA2 cDNA全长.该cDNA全长为1980 bp,命名为PtAP2.Pt-AP2核苷酸序列有一个1 539 bp完整的开放读码框(ORF),5'末端起始密码子ATG其始于290bp,3'末端非翻译区为152 bp,其中含有27 bp的Ploy+(A).该基因已在GenBank基因数据库注册,注册号为EU883665.推导该cDNA编码512个氨基酸,与苹果、矮牵牛和拟南芥中相应序列同源性分别为59.1%、59.7%和63.8%.序列分析表明,Pt-AP2除了具备完全保守的核定位信号序列(KKSR)外,还具有两个高度保守的重复序列即AP2结构域.分别采用半定量RT-PCR和SYBR Green Ⅰ实时定量RT-PCR方法分析Pt-AP2在枳叶、茎、根、花和果等不同器官中的表达水平,结果一致表明Pt-AP2在各个器官中的表达水平不同,花中的表达量最高,果实中的表达量最低.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	章镇	南京农业大学园艺学院	286	5756	35.0	58.0
2	上官凌飞	南京农业大学园艺学院	37	426	13.0	20.0
3	房经贵	南京农业大学园艺学院	194	3087	29.0	47.0
4	宋长年	南京农业大学园艺学院	40	502	16.0	21.0
5	王晨	南京农业大学园艺学院	69	628	15.0	22.0