不同烟草中谷氨酰胺合成酶2基因的生物信息学分析

• 作者: 刘全军 刘卫群 王茂 石永春
• 来源期刊: 生物技术通讯
• 学科: 生物学
• 关键词: 烟草 谷氨酰胺合成酶2 生物信息学
• 年，卷（期）: 2009,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 199-201
• 页数: 3页
• 分类号: Q78|Q811.4
• 字数: 2130字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-0002.2009.02.014

摘要

目的:分析不同烟草中谷氨酰胺合成酶2(GS2)基因的结构特点、差异与进化的关系.方法:对NCBI已公布的皱叶烟草(Np)、渐狭叶烟草(Na)和美花烟草(Ns)及拟南芥(At)、籼稻(Os)的GS2序列,利用MEGA进行聚类分析,用Prot-Param、NETPHOS 2.0 Server、TargetP 1.1 Serever、ProtScale、Scansite和SOPMA进行肽链的理化性质、磷酸化修饰、亲水性/疏水性、前导肽、motif和二级结构的预测分析.结果:Na、Ns的GS2在磷酸化位点、二级结构和前导肽方面与At和Os的GS2非常相似;Np的GS2不具有前导肽和磷酸化位点,且不定位于叶绿体中.结论:Na和Ns的GS2具有较高的相似度,但Np的GS2与Na和Ns的差别较大,与GS1的亲缘关系更近.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	石永春	河南农业大学国家烟草栽培生理生化重点实验室	34	210	9.0	13.0
5	刘卫群	河南农业大学国家烟草栽培生理生化重点实验室	94	1777	23.0	39.0
9	刘全军	河南农业大学国家烟草栽培生理生化重点实验室	27	315	11.0	17.0
10	王茂	河南农业大学国家烟草栽培生理生化重点实验室	2	17	2.0	2.0