斑节对虾亲环素A(cyclophilinA)基因的克隆及启动子序列分析

• 作者: 张殿昌 杨其彬 江世贵 王卫芳 苏天风 邱丽华 黄建华
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 斑节对虾 cyclophilinA基因 克隆 启动子 序列分析
• 年，卷（期）: 2009,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 324-331
• 页数: 8页
• 分类号: Q959
• 字数: 4709字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1005-8737.2009.03.003

摘要

通过同源克隆和RACE技术获得斑节对虾(Penaeus monodon)亲环素A(cyclophilin A,CYPA)的cDNA序列.根据已克隆的cDNA序列设计引物,利用染色体步移技术(Cenomic DNA walking)从斑节对虾卵巢组织中克隆了CYPA基因的启动子和基因组DNA序列.测序结果表明,斑节对虾亲环素A(PmCYPA)cDNA全长834 bp,其中开放阅读框(open reading frame,ORF)为495 bp,可编码164个氨基酸;5'非编码区为31 bp,3'非编码区为308 bp.从斑节对虾基因组文库中扩增的CYPA基因组DNA全长3 181 bp,其中包括启动子区域1 173 bp,1个内含子426 bp,2个外显子序列:分别为101 bp和399bp.在5'UTR上游区域有明显的启动子序列,包含一个GC盒和2个CAAT盒,同时还包含AP1、CRE等调控元件,符合真核生物典型的启动子特征.分析基因的结构表明所克隆的PmCYPA符合PPlase家族成员特征,属于此基因家族成员.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张殿昌	中国水产科学研究院南海水产研究所	35	385	13.0	18.0
2	江世贵		100	1501	22.0	31.0
3	邱丽华	中国水产科学研究院南海水产研究所	26	115	8.0	10.0
4	黄建华	中国水产科学研究院南海水产研究所	49	612	17.0	22.0
5	杨其彬	中国水产科学研究院南海水产研究所	39	481	14.0	21.0
6	苏天风	中国水产科学研究院南海水产研究所	3	33	2.0	3.0
7	王卫芳	中国水产科学研究院南海水产研究所	1	2	1.0	1.0