蒺藜苜蓿全基因组抗病基因和基因扩张分析

• 作者: 朱苏文 江海洋 汪结明 程备久 赵阳 马伟
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 苜蓿 核苷酸结合位点(NBS) 抗病基因 基因复制 生物信息学
• 年，卷（期）: 2009,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1062-1069
• 页数: 8页
• 分类号: S188
• 字数: 5195字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2009.06.019

摘要

利用BLAST(basic local alignment search tool)和HMM(hidden markov model)工具,对蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)全基因组Mt2.0数据中含有核苷酸结合位点(NBS)结构的抗病基因进行了分析,包括NBS基因数量、类型、基因复制、物理位置分析和系统进化树关系分析.结果表明,在苜蓿全基因组中找到469个含有NBS结构的抗病基因,其中包括446个标准结构NBS基因、23个非标准结构NBS基因.通过对全基因组内标准NBS类型抗病基因进行物理位置和基因家族分析,发现苜蓿基因组中抗病基因存在明显的基因复制现象,基因的复制对苜蓿基因组中NBS类型抗病基因数量扩张起到了重要的作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	朱苏文	安徽农业大学作物生物学省重点实验室	89	736	15.0	22.0
2	程备久	安徽农业大学作物生物学省重点实验室	111	852	16.0	23.0
3	江海洋	安徽农业大学作物生物学省重点实验室	45	259	10.0	14.0
4	汪结明	安徽农业大学作物生物学省重点实验室	10	139	6.0	10.0
5	赵阳	安徽农业大学作物生物学省重点实验室	18	164	7.0	12.0
6	马伟	安徽农业大学作物生物学省重点实验室	3	8	2.0	2.0