猪源和鼠源脑心肌炎病毒分离株基因组的比较分析

• 作者: 周磊 张家龙 杨汉春 查振林 盖新娜 赵婷 郭鑫 陈艳红
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 脑心肌炎病毒 猪源和鼠源毒株 基因组 序列测定 进化分析
• 年，卷（期）: 2009,（6）
• 所属期刊栏目: 预防兽医
• 页码范围: 873-878
• 页数: 6页
• 分类号: S852.659.6
• 字数: 2677字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0366-6964.2009.06.015

摘要

为了分析猪源和鼠源脑心肌炎病毒(EMCV)基因组的差异,对分离自同一猪场猪临床样本和鼠组织样本的2株病毒(GX0601和GX0602)进行了全基因组序列测定和比较分析.结果显示,2个分离毒株的基因组全长(包含poly A)分别为7 729和7 725 nt,核苷酸和氨基酸同源性均在99.8%以上.与国外毒株及国内已报道的分离株的序列比较结果表明,2个毒株与BJC3和HBl的核苷酸同源性为98.18%～99.41%,推导的氨基酸序列同源性为99.5%～99.7%,与国外分离株的核苷酸序列和氨基睃序列的同源性分别介于80.53%～99.57%和93.1%～99.5%.基于基因组开放阅读框推导的氨基酸序列的系统进化分析表明,我国分离毒株与国外毒株PEC9、CBNU、BEL-2887A/91和EMCV-R的同源性较高,位于同一个亚群.研究结果提示,猪源与鼠源毒株的基因组具有很高的同源性,鼠是猪场EMCV感染的传染来源.