猪脑心肌炎病毒GXLC株VP1基因的克隆与序列分析

• 作者: 屈素洁 施开创 李向涛 许瑞胜 郑敏 陈宏备 陈进喜
• 来源期刊: 动物医学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 猪 脑心肌炎病毒 VP1基因 分子特征
• 年，卷（期）: 2010,（8）
• 页码范围: 45-50
• 分类号: S852.659.6|Q786
• 字数: 4008字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-5038.2010.08.011

摘要

应用RT-PCR方法扩增猪脑心肌炎病毒GXLC株的VP1基因,扩增产物克隆入pMD 18-T载体后进行测序,对获得的VP1基因序列进行分析.序列分析表明,GXLC株VP1基因长度为831 bp,编码277 aa,含有2个潜在的N-糖基化基序和9个抗原表位.同源性分析表明,GXLC株与国内外其他26个EMCV分离株VP1基因核苷酸序列的同源性在78.6%～99.6%之间、氨基酸序列的同源性在95.1%～99.3%之间.遗传进化分析表明,基于VP1基因序列绘制的系统进化树可以将所有EMCV分离株分成两个群,即Ⅰ群和Ⅱ群,Ⅰ群可再细分为Ⅰa亚群和Ⅰb亚群,其中猪源、鼠源EMCV在Ⅰ群和Ⅱ群中均有分布,人源EMCV则分布在Ⅱ群;GXLC株与其他中国分离株均属于Ⅰa亚群.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈进喜		19	35	4.0	5.0
2	许瑞胜	广西大学动物科学技术学院	4	15	3.0	3.0
3	施开创		46	217	7.0	12.0
4	李向涛	广西大学动物科学技术学院	9	48	5.0	6.0
5	陈宏备	广西大学动物科学技术学院	5	15	3.0	3.0
6	郑敏		33	115	6.0	8.0
7	屈素洁		28	57	4.0	5.0