人NIRF基因真核表达质粒的构建及其蛋白产物的生物信息学分析

• 作者: 常蕾 段昌柱 钱冠华
• 来源期刊: 中国生物制品学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: NIRF基因 克隆 真核表达质粒 生物信息学
• 年，卷（期）: 2009,（1）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 6-9
• 页数: 4页
• 分类号: Q784|R318.04
• 语种: 中文

摘要

目的 克隆人NIRF基因,构建其真核表达质粒.并运用生物信息学方法对NIRF蛋白进行分析.方法 应用RT-PCR技术,从HeLa细胞中扩增NIRF基因,插入到真核表达载体pcDNA3.1-Flag中,双酶切鉴定并测序.在NCBI蛋白质结构数据库中寻找与NIRF具有较高同源性的1WY8和1Z6U,并利用Insight Ⅱ结构生物信息学分析软件分析NIRF蛋白的结构和功能.结果 扩增出约2 400 bp的人NIRF全长cDNA;重组真核表达质粒pcDNA3.1-Flag-NIRF酶切后,可见约2 400 bp的目的 片段;测序结果表明NIRF全长cDNA与GenBank中NIRF序列完全一致.1WY8片段有3个赖氨酸残基,主要位于蛋白空间构象的表面;1Z6U片段含有Ring finger结构域,具有ligase活性.结论 已成功克隆了人NIRF基因全长cDNA,构建了其真核表达质粒,并利用生物信息学方法,初步分析了NIRF蛋白泛素化作用的机理.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	常蕾	重庆医科大学细胞生物学教研室	3	14	2.0	3.0
2	段昌柱	重庆医科大学细胞生物学教研室	35	120	7.0	9.0
3	钱冠华	重庆医科大学细胞生物学教研室	8	24	3.0	4.0