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摘要:
目的 建立基于16S rDNA快速鉴定细菌的PeR测序方法(PCR-SBT).方法 通过一组16S rDNA通用引物扩增得到基因组全长,PCR产物经纯化后直接测序分析.利用BLAST软件从GenBank数据库中搜索相关菌株的16S rDNA全序列,采用Clustal X软件进行多序列比对和同源性分析,确定细菌的种属,并与常规生化鉴定结果比较.利用大肠杆菌基因组一系列稀释度标本进行PeR扩增,检测方法的敏感性.结果 实验利用多对引物建立了16S rDNA全长序列分析方法,13个标准菌株通过PCR-SBT方法获得约1400 bp的全长序列.比对分析13个标准菌株测序结果与预期标准序列完全一致,证实建立的PCR-SBT方法结果可靠.利用建立的PCR-SBT法,对实验室从血小板制品和脐带血中分离得到不同未知菌株进行鉴定,成功确定了这些菌株的种属.以大肠杆菌DNA为模板,方法的最低检测限为反应体系DNA含量0.2 ng.结论 建立的基于16S rDNA的PCR-SBT方法是可行的,可快速准确地检测及鉴定细菌种类,尽早发现细菌污染血制品,对污染血制品输注后的针对性治疗方面具有潜在的应用价值.
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文献信息
篇名 16S rDNA快速鉴定血液制品中污染细菌的测序方法的建立
来源期刊 中华微生物学和免疫学杂志 学科
关键词 血液细菌污染 16S rDNA 多聚酶链反应.测序方法
年,卷(期) 2009,(10) 所属期刊栏目 细菌学
研究方向 页码范围 880-883
页数 4页 分类号
字数 3693字 语种 中文
DOI 10.3760/cma.j.issn.0254-5101.2009.10.003
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 应燕玲 浙江省血液中心输血研究所卫生部血液安全研究重点实验室 8 34 3.0 5.0
2 朱发明 浙江省血液中心输血研究所卫生部血液安全研究重点实验室 108 522 13.0 18.0
3 吕杭军 浙江省血液中心输血研究所卫生部血液安全研究重点实验室 69 342 11.0 14.0
4 严力行 浙江省血液中心输血研究所卫生部血液安全研究重点实验室 91 548 14.0 18.0
5 许先国 浙江省血液中心输血研究所卫生部血液安全研究重点实验室 52 370 13.0 17.0
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研究主题发展历程
节点文献
血液细菌污染
16S rDNA
多聚酶链反应.测序方法
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
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相关学者/机构
期刊影响力
中华微生物学和免疫学杂志
月刊
0254-5101
11-2309/R
大16开
北京市经济技术开发区经海二路38号
2-55
1981
chi
出版文献量(篇)
5865
总下载数(次)
10
总被引数(次)
26456
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