基于词汇化随机文法模型的RNA二级结构预测

• 作者: 周勇 唐四薪 邹赛
• 来源期刊: 计算机工程与科学
• 学科: 工学
• 关键词: RNA二级结构 随机文法 词汇化 结构预测
• 年，卷（期）: 2009,（3）
• 所属期刊栏目: 研究与实现
• 页码范围: 128-131
• 页数: 4页
• 分类号: TP301.2|Q71|O157.6
• 字数: 3741字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-130X.2009.03.036

摘要

针对经典的随机文法模型预测RNA二级结构存在精度不高的问题,本文给出了一种词汇化随机文法模型预测RNA二级结构的方法.首先,用最大熵模型获取RNA序列中的词条信息,通过Viterbi算法搜索每个词条被标注为某种二级结构类型的最大概率;然后,将这些词条信息作为先验信息在随机文法模型训练过程中引入,从而加快对二级结构的搜索过程,提高准确率.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	唐四薪	衡阳师范学院计算机科学系	16	20	3.0	3.0
2	周勇	衡阳师范学院数学系	19	78	4.0	8.0
3	邹赛	衡阳师范学院计算机科学系	17	30	4.0	4.0