基于随机文法云模型的RNA二级结构预测

• 作者: 周勇 唐四薪 谭晓兰
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: RNA二级结构 随机文法 词汇化 结构预测
• 年，卷（期）: 2012,（10）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 5765-5767,5911
• 分类号: S-058|S126
• 字数: 5067字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0517-6611.2012.10.016

摘要

[目的]研究基于随机文法云模型预测RNA二级结构的方法.[方法]将云模型引入到随机文法模型中,提出适合于词汇化随机文法模型的机器学习算法,通过词网格模型对RNA序列进行词条获取和划分,再经过云分类器搜索每个词条被标注为某种二级结构类型的最大概率,然后将这些词条信息作为先验信息在随机文法云模型训练过程中引入,实现对RNA二级结构的预测,并对该方法进行试验检测.[结果]试验测试表明,在随机文法模型中引入云模型后,其在预测的准确度和搜索速度上较单纯的随机文法效果有明显改善.[结论]该研究为随机文法模型在RNA二级结构预测中的广泛应用奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	谭晓兰	衡阳师范学院计算机科学系	15	23	2.0	3.0
2	唐四薪	衡阳师范学院计算机科学系	16	20	3.0	3.0
3	周勇	衡阳师范学院数学系	19	78	4.0	8.0