柑橘碎叶病毒外壳蛋白基因的克隆和序列分析

• 作者: 刘科宏 周常勇 唐科志 宋震 李中安 杨方云
• 来源期刊: 中国农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 柑橘碎叶病毒 CTLV 外壳蛋白基因 克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2009,（10）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 3741-3748
• 页数: 8页
• 分类号: S2
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2009.10.0046

摘要

[目的] 了解中国CTLV分离物外壳蛋白(CP)基因的变异情况.[方法] 对来源于中国不同地区、不同寄主品种的18个柑橘碎叶病毒(CTLV)分离物进行RT-PCR、克隆、测序,应用DNAMAN软件进行序列分析,[结果] 18个分离物的cP基因全长714 nt,推导的CP含237个氨基酸.CP核苷酸序列及推导的氨基酸序列最大相似性分别为88.5%～99.9%和91.1%～99.6%.与核苷酸序列G289→A或C、A409→C和G414→T的单碱基突变相对应,CTLV外壳蛋白第97、1 37、138位氨基酸在强、弱毒分离物之间存在差异,多数弱毒分离物为Q97或K97、Q137、H138,而多数强毒分离物为E97、R137或K137、Q138.在根据CP氨基酸序列构建的系统进化树上,本研究获得的18个CTLV分离物至少可以划分为2个组群,其中,在指示植物上表现较弱症状的多数(4/6)CTLV分离物划分在第1组群,多数(10/12)CTLV强毒分离物划分在第Ⅱ组群.[结论] CTLV外壳蛋白基因相对保守,其第289、409、414位碱基在强、弱毒分离物之间存在差异,可能与病毒致病性相关.