贯叶金丝桃查尔酮合成酶基因的生物信息学分析

• 作者: 任源浩 宋东杰 李朝晖 杨平 秦春 陈全战
• 来源期刊: 时珍国医国药
• 学科: 医学
• 关键词: 贯叶金丝桃 查尔酮合成酶基因 生物信息学
• 年，卷（期）: 2009,（10）
• 所属期刊栏目: 基金项目
• 页码范围: 2514-2516
• 页数: 3页
• 分类号: R284.2
• 字数: 2106字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1008-0805.2009.10.064

摘要

目的 用生物信息学软件分析贯叶金丝桃查尔酮合成酶基因编码蛋白的多种蛋白质性质,获取该基因的相关因素.方法 利用Protparam,GOR4,ProtScale,Protfun和NetPhos软件预测和分析贯叶金丝桃查尔酮合成酶基因编码蛋白的氨基酸组成、理论等电点、结构域、活性位点、卷曲螺旋、疏水性、糖基化位点、磷酸化位点及二级结构.结果 推测贯叶金丝桃查尔酮合成酶基因编码蛋白分子式为:C1910H3056N508O565S18,理论等电点pI 6.12;并含有一个查尔酮合成酶活性位点:156 - 172( RLmMyQqGCFAGGTvLR).该蛋白含有163个α-螺旋,81个延伸链,145个无规则卷曲,1个N-糖基化位点,1个O-糖基化位点,17个磷酸化位点,包括8个丝氨酸磷酸化位点,8个苏氨酸磷酸化位点和1个酪氨酸磷酸化位点.结论 该蛋白推测是一个疏水性稳定蛋白,属于连接酶.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈全战		104	607	12.0	18.0
2	杨平		49	163	7.0	10.0
3	宋东杰		33	156	8.0	11.0
4	李朝晖		66	364	12.0	15.0
5	任源浩		26	109	6.0	9.0
6	秦春	南京农业大学生命科学学院	5	59	3.0	5.0