猪带绦虫乳酸脱氢酶A和B的生物信息学比较分析

• 作者: 余新炳 廖兴江 徐劲 戴佳琳 杜武英 胡旭初 黄江 黄艳
• 来源期刊: 热带医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 猪带绦虫 乳酸脱氢酶 同工酶 生物信息学
• 年，卷（期）: 2010,（3）
• 所属期刊栏目: 硕博专栏论著
• 页码范围: 241-247,封4
• 分类号: R383.32
• 语种: 中文

摘要

目的 预测及比较分析猪带绦虫乳酸脱氢酶A(Taenia solium lactate dehydrogenase A,TsLDH-A)和乳酸脱氢酶B(Taenia solium lactate dehydrogenase B,TsLDH-B),用于指导其生物学功能的研究.方法 利用生物信息网站如美国国家生物技术信息中心(NCBI,http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)和瑞士生物信息学研究所的蛋白分析专家系统(ExPASY,http://ca.expasy.org/)中有关基因和蛋白的序列和结构信息分析的各种工具,结合其它生物信息学分析软件包,从猪带绦虫成虫全长cDNA质粒文库中识别LDH-A和LDH-B的全长编码基因并对其结构与功能进行生物信息学预测分析.结果 两序列都是包含完整开放阅读框的全长基因,推导出的氨基酸序列与其它物种LDH-A或LDH-B同源基因的氨基酸序列的一致性均大于50%.两者编码的蛋白在编码的氨基酸数目(331)、蛋白的理化性质、L-乳酸脱氢酶结构域、构成LDH酶催化中心的关键氨基酸、包含LDH活性位点的线性表位、无亚细胞定位等方面是一致的,但两者在翻译后的修饰位点、3个跨膜区和其他线性表位方面既相似也有区别.结论 应用生物信息方法从猪带绦虫成虫cDNA文库中筛选出了TsLDH-A和TsLDH-B的cDNA全长序列,并预测和比较了两者结构与功能方面的信息,为进一步研究所编码蛋白的功能奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	余新炳	中山大学中山医学院寄生虫学教研室	201	1352	17.0	28.0
2	徐劲	中山大学中山医学院寄生虫学教研室	104	568	13.0	17.0
3	胡旭初	中山大学中山医学院寄生虫学教研室	108	574	13.0	17.0
4	黄江	贵阳医学院寄生虫学教研室	76	329	11.0	14.0
5	黄艳	中山大学中山医学院寄生虫学教研室	69	318	9.0	13.0
6	廖兴江	贵阳医学院寄生虫学教研室	46	215	8.0	12.0
7	戴佳琳	贵阳医学院寄生虫学教研室	38	96	5.0	7.0
8	杜武英	贵阳医学院寄生虫学教研室	5	24	3.0	4.0