细菌外毒素序列中特有模体的识别及其基因本体注释分析

• 作者: 宁保安 岳俊杰 梁龙 牛超 王月兰 高志贤
• 来源期刊: 微生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 外毒素 模体 基因本体
• 年，卷（期）: 2010,（9）
• 页码范围: 1246-1250
• 分类号: Q933
• 语种: 中文

摘要

[目的]识别细菌外毒素序列中特有模体,进一步理解外毒素的致病机制.[方法]构建非致病性细菌蛋白质数据库,利用InterProScan对数据库中非致病菌蛋白质序列以及收集的经实验确认的89条细菌外毒素蛋白质序列进行模体搜索.[结果]在89条细菌外毒素序列中,分析得到了39个细菌外毒素特有模体.[结论]得到的外毒素特有模体与外毒素功能密切相关,为在致病性细菌基因组内搜索外毒素序列奠定了基础;同时通过对外毒素特有模体的基因本体(Gene ontology,GO)注释分析,进一步阐明了细菌外毒素的致病机制.