一个新的水稻低温应答类糖基转移酶基因(OsCrGtl)的表达分析与克隆

• 作者: Rocha Pedro 夏新界 张俊 徐国云 徐孟亮 李落叶 王曼玲 陈荣军
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 水稻 逆境 基因芯片 实时定量RT-PCR 糖基转移酶
• 年，卷（期）: 2010,（4）
• 页码范围: 663-669
• 分类号: S5
• 字数: 4171字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2010.04.006

摘要

采用Affymetrix 60 K水稻基因表达芯片系统分析了水稻培矮64S(Oryza sativa ssp.indica)在低温、高温和干旱条件下不同生育时期的叶片与穗全基因组的转录丰度,筛选出一个类糖基转移酶基因OsCrGtl(Oryza sativacold responsive glycosyltransferase-like gene,GenBank登录号为FJ828672),该基因主要受低温诱导且在各生育时期的表达量均显著上调.用实时定量RT-PCR方法对该基因的在逆境条件下的转录丰度进行了验证分析,也得到与基因芯片分析基本相同的结果.以培矮64S mRNA为模板,通过RT-PCR方法扩增,得到包含其完整开放阅读框的cDNA克隆.根据其开放阅读框的核苷酸序列推测,OsCrGtl编码一个包含462个氨基酸残基的蛋白质,理论分子量为50.327kD,等电点为5.35.查询蛋白质数据库,得知该基因编码的蛋白质与籼稻(indica)、粳稻(japonica)、玉米(Zea mays)及拟南芥(Arabidopsis thaliana)编码的糖基转移酶家族蛋白相似,且包含糖基转移酶结构域.对其推测的启动子区域核苷酸序列进行分析,找到9个可能与逆境应答有关的顺式作用元件.