芸薹属作物EST-SNP的发掘与分析

• 作者: 张耿 李雪姣 王彦华 赵建军 轩淑欣 顾爱侠
• 来源期刊: 植物遗传资源学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 芸薹属 序列表达标签(EST) 单核苷酸多态性(SNP) 分子标记
• 年，卷（期）: 2010,（6）
• 页码范围: 772-776
• 分类号: Q94
• 字数: 3507字
• 语种: 中文

摘要

芸薹属作物是十字花科中重要的蔬菜和油用作物,经济价值和食用价值比较高.本研究通过生物信息学手段,从3个芸薹属物种EST序列中获得了大量的SNP和Indel资源,对SNP与EST的数量及拼接结果之间的关系、SNP碱基置换的偏好性、Indel碱基数量与发生频率之间的关系进行了分析.分析结果对深入研究芸薹属基因组特点具有一定的参考价值,为进一步通过试验验证预测的SNP位点、开发该作物高通量SNP分子标记奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	顾爱侠	河北农业大学园艺学院	20	278	10.0	16.0
2	王彦华	河北农业大学园艺学院	79	1110	17.0	28.0
3	轩淑欣	河北农业大学园艺学院	56	693	16.0	23.0
4	赵建军	河北农业大学园艺学院	30	313	11.0	16.0
5	张耿	浙江大学农业与生物技术学院作物所	2	27	2.0	2.0
6	李雪姣	河北农业大学园艺学院	7	47	5.0	6.0