香蕉枯萎病菌cyp1基因的克隆与序列分析

• 作者: 方晓东 杨歆璇 杨腊英 羊玉花 谢玉萍 黄俊生 黄小娟
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 尖孢镰刀菌古巴专化型 生理小种 亲和蛋白基因 寄主选择性
• 年，卷（期）: 2010,（2）
• 所属期刊栏目: 作物病虫害及其防治、环境保护
• 页码范围: 248-252
• 页数: 5页
• 分类号: S432.4
• 字数: 3960字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2010.02.016

摘要

为了解亲环素基因(cyp1.其编码亲和蛋白)在尖孢镰刀菌古巴专化型生理小种1号和生理小种4号之间及与其他镰刀菌之间的差异,分析cyp1基因与两生理小种之间的寄主选择性差异的关系,通过比对现有镰刀菌属的亲环素基因序列,设计并合成引物.采用PCR和RT-PCR方法扩增了尖孢镰刀菌古巴专化型生理小种1号和生理小种4号2个生理小种的cypl基因,并测序进行比较分析,同时对编码蛋白进行了氨基酸序列比对和功能分析.结果表明,2个生理小种cypl基因全长均为1066 bp.开放阅读框均为675 bp,编码224个氨基酸,基因序列间差异性为0.8%,编码蛋白间仅存在1个氨基酸的差异;两生理小种的cypl基因序列与镰刀菌属其他专化型或不同种间存在差异性,与不同属之间其他种间的差异最大达50%.比对蛋白序列发现仅存在0.85%的差异,这进一步证明亲和蛋白在真菌中较保守.从cyp1基因序列及其编码蛋白的氨基酸序列在两生理小种之间的差异性分析结果推测,2个生理小种寄主选择性差异与cyp1基因并无明显对应关系,这为进一步研究cypl基因功能奠定了基础.