鸡Z染色体基因表达的密码子偏性

• 作者: 张细权 柴学文 梁菲菲 王樟凤 饶友生
• 来源期刊: 华南农业大学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 鸡 Z染色体 密码子 偏性
• 年，卷（期）: 2010,（1）
• 所属期刊栏目: 动物科学与兽医学
• 页码范围: 70-74
• 页数: 5页
• 分类号: Q953.3
• 字数: 3588字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-411X.2010.01.017

摘要

从NCBI 数据库(http:∥www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/mapview/map)下载鸡Z染色体上全部基因完整的cDNA,最终共有626个基因的CDS序列纳入统计分析.使用CodonW(1.4.2)进行密码子偏性分析,确定了CGG、AGC、UGC等26个密码子为Z染色体基因表达的"最优"密码子.对应分析表明,影响鸡Z染色体基因表达的密码子偏性的主要因素分别为GC3s、基因的表达丰度、GC含量、CDS长度及氨基酸的疏水性.鸡Z染色体基因表达的密码子用法受到了核苷酸组成偏好的显著影响,这种核苷酸组成偏好很可能是突变偏畸、固定偏畸及基因转换导致的.对于鸡这种群体有效规模较大的群体,密码子的偏性更有可能是核苷酸组成偏好及选择等因素综合作用的结果.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张细权	华南农业大学动物科学学院	109	1363	19.0	31.0
2	饶友生	江西教育学院生物技术研究所	18	110	6.0	10.0
3	王樟凤	江西教育学院生物技术研究所	10	33	3.0	5.0
4	柴学文	江西教育学院生物技术研究所	8	26	2.0	5.0
5	梁菲菲	华南农业大学动物科学学院	2	32	2.0	2.0