珍珠鸟(Taeniopygia guttata)小染色体基因表达的密码子偏性

• 作者: 彭武林 柴学文 王樟凤 饶友生 黄润红
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: 珍珠鸟 小染色体 密码子偏性
• 年，卷（期）: 2013,（4）
• 所属期刊栏目: 研究快报
• 页码范围: 293-296
• 页数: 4页
• 分类号: Q953.3
• 字数: 2564字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2013.04.09

摘要

从NCBI数据库(http:∥www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/mapview/map)下载珍珠鸟全部小染色体基因的cDNA序列,最终共有l 586个基因的CDS序列纳入统计分析.密码子的偏性分析使用CodonW (1.4.2)完成,初步确定了UUC、UCC、UCG等27个密码子为珍珠鸟小染色体基因表达的“最优”密码子.对应分析表明,影响珍珠鸟小染色体基因密码子使用的主要因素分别为GC3s、CDS的GC含量基以及因的表达丰度.珍珠鸟小染色体基因的密码子用法受到了基因碱基组成的显著影响,其密码子的偏性是碱基组成及选择等因素综合作用的结果.本研究的目的是系统探究珍珠鸟小染色体基因的密码子用法,探究鸟类基因表达的分子调控机制.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王樟凤	南昌师范学院生物技术研究所	7	8	2.0	2.0
2	柴学文	南昌师范学院生物技术研究所	9	8	2.0	2.0
3	黄润红	南昌师范学院生物技术研究所	2	0	0.0	0.0
4	彭武林	南昌师范学院生物技术研究所	2	0	0.0	0.0
5	饶友生	南昌师范学院生物技术研究所	10	15	3.0	3.0