晚疫病诱导的番茄叶片cDNA文库构建及序列分析

• 作者: 朱海山 杨婷婷 赵凯
• 来源期刊: 中国农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 番茄 晚疫病 Cdna文库 EST序列分析
• 年，卷（期）: 2010,（5）
• 页码范围: 65-70
• 分类号: S682
• 语种: 中文

摘要

以番茄抗病品系(CLN2037E)为研究材料,应用SMART技术构建晚疫病诱导的番茄叶片cDNA表达文库,并进行生物信息学分析.成功构建的cDNA文库的克隆数为2.3×102,重组率为96%,通过PCR检测,插入片段范围在0.1～2.0 kb之间.从文库中随机挑取110个克隆进行测序,最终得到107条差异表达ESTs序列.GenBank提交的序列号为GT742146-GT742150;GT865998-GT866099.利用BLAST进行同源性分析:75条ESTs与其他物种同源性较高,视为已知基因,功能涉及能量代谢的占42.7%、细胞内生命活动与信号传导的占10.7%、基因转录和翻译的占9.3%以及与抗性相关的占25.3%;另有32条ESTs无同源序列或同源性较低,预测是一些未知功能基因的占30%.本项研究应用SMART技术成功构建了高质量、信息丰富的晚疫病诱导的番茄叶片cDNA文库,为进一步筛选抗病相关候选基因奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	朱海山	云南农业大学园林园艺学院	47	176	8.0	11.0
2	赵凯	云南农业大学园林园艺学院	48	122	5.0	7.0
3	杨婷婷	云南农业大学园林园艺学院	4	32	3.0	4.0