禽流感病毒H9N2亚型西藏分离株HA和NA基因的克隆与序列分析

• 作者: 王灿 索朗斯珠 邹威 金梅林 陈焕春
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 禽流感病毒 H9N2亚型 HA基因 NA基因 遗传变异分析
• 年，卷（期）: 2010,（12）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 1659-1666
• 分类号: S852.659.5
• 字数: 5019字
• 语种: 中文

摘要

为了从分子水平上掌握西藏各地区H9亚型禽流感病毒的遗传进化情况及其与国内外H9亚型禽流感病毒的变异情况和流行规律之间的关系,作者选择了2009年不同时间从西藏部分地市养殖场分离的3株禽流感H9N2亚型毒株,采用RT-PCR技术对其HA和NA基因进行扩增、克隆和测序,并对所得全序列进行同源性和遗传进化分析.结果显示,3株西藏分离病毒之间的HA和NA基因变异程度不大,同源性达到98%以上,在遗传进化中均属于欧亚分支中的类Bj/94亚分支,3株西藏分离毒的HA基因与Bj/94的同源性在核苷酸水平为88.7%～88.8%,在氨基酸水平为93.4%～93.6%;NA基因与Bj/94的同源性在核苷酸水平为92.7%～93.0%,在氨基酸水平为93.4%～94.0%;3株西藏分离毒株可能与Bj/94由同一毒株进化而来.由于基因突变使Tb/1毒株的HA基因在313位出现了1个新的糖基化位点,Tb/4毒株的NA基因缺失了146位的糖基化位点;唾液酸吸附位点上有明显的突变;HA的裂解位点附近和NA基因的受体结合位点区域内都有氨基酸突变.HA和NA基因的变异可能与适应高原缺氧、高海拔等特殊气候环境有关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈焕春	华中农业大学农业微生物国家重点实验室动物病毒分室	331	4866	36.0	53.0
2	金梅林	华中农业大学农业微生物国家重点实验室动物病毒分室	81	896	15.0	27.0
3	索朗斯珠	华中农业大学农业微生物国家重点实验室动物病毒分室	74	142	6.0	9.0
5	邹威	华中农业大学农业微生物国家重点实验室动物病毒分室	2	6	1.0	2.0
8	王灿	华中农业大学农业微生物国家重点实验室动物病毒分室	1	5	1.0	1.0